• فيسبوڪ
  • ڳنڍيل
  • يوٽيوب

1. بنيادي ڄاڻ (جيڪڏهن توهان تجرباتي حصو ڏسڻ چاهيو ٿا، مهرباني ڪري سڌو سنئون ٻئي حصي ڏانهن منتقل ڪريو)

روايتي پي سي آر جي نڪتل رد عمل جي طور تي، حقيقي وقت پي سي آر بنيادي طور تي پي سي آر ايمپليفڪيشن جي رد عمل جي هر چڪر ۾ ايمپليفڪيشن پراڊڪٽ جي مقدار جي تبديلي کي حقيقي وقت ۾ فلوروسينس سگنل جي تبديلي جي ذريعي مانيٽر ڪري ٿو، ۽ ct قدر ۽ معياري وکر جي وچ ۾ تعلق ذريعي شروعاتي ٽيمپليٽ کي مقداري طور تي تجزيو ڪري ٿو.

RT-PCR جي مخصوص ڊيٽا آهنبيس لائين, fluorescence حد۽سي ٽي قدر.

بيس لائين: 3rd-15th چڪر جي فلوروسينس قدر بيس لائين (بيس لائين) آهي، جيڪا ماپ جي ڪڏهن ڪڏهن غلطي جي ڪري ٿي.
حد (حد): fluorescence معلوم ڪرڻ جي حد ڏانهن اشارو ڪري ٿو هڪ مناسب پوزيشن تي مقرر ڪيل وڌاء واري ترقي واري علائقي ۾ ايمپليفڪيشن وکر، عام طور تي 10 ڀيرا بيس لائين جي معياري انحراف.
CT قدر: اهو PCR سائيڪلن جو تعداد آهي جڏهن هر رد عمل ٽيوب ۾ فلورسنس قيمت حد تائين پهچي ٿي.
Ct قدر inversely متناسب آهي ابتدائي ٽيمپليٽ جي مقدار سان.

 siRNA in1 بابت ڪجھ تجربو

RT-PCR لاءِ عام ليبلنگ جا طريقا:

طريقو فائدو نقص درخواست جي گنجائش
SYBR گرينⅠ وسيع قابل اطلاق، حساس، سستو ۽ آسان پرائمر جون گهرجون وڏيون آهن، غير مخصوص بينڊن لاءِ پراون اهو مختلف ٽارگيٽ جين جي مقدار جي تجزيي لاءِ موزون آهي، جين جي اظهار تي تحقيق، ۽ ٽرانسجنڪ ٻيهر ٺهندڙ جانورن ۽ ٻوٽن تي تحقيق.
تاقمان سٺي specificity ۽ اعلي repeatability قيمت اعلي آهي ۽ صرف مخصوص مقصدن لاء مناسب آهي. پيٽروجن جي ڳولا، دوا جي مزاحمت جين جي تحقيق، دوا جي اثرائتي تشخيص، جينياتي بيمارين جي تشخيص.
ماليڪيولر بيڪن اعلي خاصيت، فلورسنس، گهٽ پس منظر قيمت اعلي آهي، اهو صرف هڪ خاص مقصد لاء مناسب آهي، ڊزائن ڏکيو آهي، ۽ قيمت اعلي آهي. مخصوص جين تجزيو، SNP تجزيو

siRNA in2 بابت ڪجھ تجربو siRNA in3 بابت ڪجھ تجربو

2. تجرباتي قدم

2.1 تجرباتي گروپ جي باري ۾- گروپ ۾ ڪيترائي کوهه هجڻ گهرجن، ۽ اتي حياتياتي ورجائي هجڻ گهرجي.

خالي ڪنٽرول تجربن ۾ سيل جي ترقي جي حالت کي ڳولڻ لاء استعمال ڪيو ويو
منفي ڪنٽرول siRNA (غير مخصوص siRNA تسلسل) RNAi عمل جي خاصيت کي ظاهر ڪريو.siRNA 200nM جي ڪنسنٽريشن تي غير مخصوص دٻاءُ واري ردعمل کي جنم ڏئي سگھي ٿو.
منتقلي ريجنٽ ڪنٽرول سيلز ڏانهن منتقلي ريگينٽ جي زهر کي خارج ڪريو يا ٽارگيٽ جين جي اظهار تي اثر
ٽارگيٽ جين جي خلاف siRNA ٽارگيٽ جين جي اظهار کي دٻايو
⑤ (اختياري) مثبت siRNA تجرباتي نظام ۽ آپريشنل مسئلن کي حل ڪرڻ لاء استعمال ڪيو ويو
⑥ (اختياري) فلورسنٽ ڪنٽرول siRNA سيل جي منتقلي جي ڪارڪردگي کي خوردبيني سان مشاهدو ڪري سگهجي ٿو

2.2 پرائمر ڊيزائن جا اصول

وڌايل ٽڪرا سائيز ترجيحي طور تي 100-150bp تي
پرائمر ڊگھائي 18-25 بي پي
جي سي مواد 30%-70%، ترجيحي طور تي 45%-55%
Tm قدر 58-60 ℃
تسلسل مسلسل T/C کان پاسو ڪريو؛A/G لڳاتار
3 آخري تسلسل GC rich يا AT rich کان پاسو ڪريو؛ٽرمينل بنياد ترجيحي طور تي G يا سي آھي؛T کان بچڻ لاء بهترين آهي
مڪمل ڪرڻ پرائمر جي اندر يا ٻن پرائمر جي وچ ۾ 3 کان وڌيڪ بيسز جي ضمني ترتيبن کان پاسو ڪريو
خاصيت پرائمر جي خاصيت جي تصديق ڪرڻ لاءِ ڌماڪي جي ڳولا استعمال ڪريو

①SiRNA نسلن لاءِ مخصوص آهي، ۽ مختلف نسلن جا سلسلا مختلف هوندا.

②SiRNA منجمد خشڪ پائوڊر ۾ پيڪ ٿيل آهي، جنهن کي ڪمري جي حرارت تي 2-4 هفتن تائين مستحڪم طور تي محفوظ ڪري سگهجي ٿو.

2.3 اوزار يا ريجنٽ جيڪي اڳ ۾ تيار ٿيڻ گهرجن

پرائمر (اندروني حوالو) جنهن ۾ اڳتي ۽ پوئتي ٻه شامل آهن
پرائمر (ٽارگٽ جين) جنهن ۾ اڳتي ۽ پوئتي ٻه شامل آهن
ٽارگيٽ سي آر اين اي (3 پٽي) عام طور تي، ڪمپني 3 پٽي ٺاهيندي، ۽ پوء RT-PCR ذريعي ٽن مان هڪ کي چونڊيو.
منتقلي کٽ Lipo2000 وغيره.
RNA Rapid Extraction Kit منتقلي کان پوء آر اين اي ڪڍڻ لاء
ريپڊ ريورس ٽرانسپشن کٽ cDNA synthesis لاءِ
PCR Amplification Kit 2 × سپر SYBR گرين
qPCR ماسٽر ميڪس

2.4 مسئلن جي حوالي سان جن کي خاص تجرباتي مرحلن ۾ ڌيان ڏيڻ جي ضرورت آهي:

①siRNA منتقلي جو عمل

1. پليٽنگ لاءِ، توھان 24-ڪھڙي پليٽ، 12-ڪھڙي پليٽ يا 6-ڪھڙي پليٽ چونڊي سگھو ٿا (24-ڪھڙي پليٽ جي ھر کوھ ۾ تجويز ڪيل سراسري RNA ڪنسنٽريشن اٽڪل 100-300 ng/uL آھي)، ۽ سيلز جي بھترين منتقلي جي کثافت 60٪ -80٪ ​​تائين آھي.

2. منتقلي جا مرحلا ۽ مخصوص گهرجن سختي سان هدايتن جي مطابق آهن.

3. منتقلي کان پوءِ، نمونا گڏ ڪري سگهجن ٿا 24-72 ڪلاڪن اندر mRNA جي چڪاس (RT-PCR) يا پروٽين جي چڪاس لاءِ 48-96 ڪلاڪن اندر (WB)

② آر اين اي ڪڍڻ وارو عمل

1. exogenous enzymes ذريعي آلودگي کي روڪڻ.ان ۾ خاص طور تي ماسڪ پائڻ ۽ دستانو سختي سان شامل آهن؛sterilized pipette ٽپس ۽ EP ٽيوب استعمال ڪندي؛تجربو ۾ استعمال ٿيل پاڻي RNase-Free هجڻ گهرجي.

2. ان کي ٻه ڀيرا ڪرڻ جي صلاح ڏني وئي آهي جيئن جلدي ڪڍڻ واري کٽ ۾ تجويز ڪيل آهي، جيڪا حقيقت ۾ پاڪائي ۽ پيداوار کي بهتر بڻائي سگهندي.

3. فضول مايع کي آر اين اي ڪالم کي ڇهڻ نه گهرجي.

③ آر اين اي جي مقدار

آر اين اي ڪڍڻ کان پوء، ان کي سڌو سنئون نانوڊروپ سان مقدار ڪري سگهجي ٿو، ۽ گهٽ ۾ گهٽ پڙهڻ 10ng / ul جيترو ٿي سگهي ٿو.

④ ريورس ٽرانسپشن عمل

1. RT-qPCR جي اعليٰ حساسيت جي ڪري، هر نموني لاءِ گهٽ ۾ گهٽ 3 متوازي کوهه ٺاهڻ گهرجن ته جيئن پوءِ ايندڙ Ct کي تمام گهڻو مختلف ٿيڻ کان روڪيو وڃي يا شمارياتي تجزيي لاءِ SD تمام وڏو نه ٿئي.

2. ماسٽر ميڪس کي بار بار منجمد نه ڪريو ۽ ٿڪايو.

3. هر ٽيوب/سوراخ کي نئين ٽپ سان تبديل ڪيو وڃي!نموني شامل ڪرڻ لاءِ مسلسل ساڳي پائيپٽ ٽپ استعمال نه ڪريو!

4. نموني کي شامل ڪرڻ کان پوء 96-سٺي پليٽ سان ڳنڍيل فلم کي پليٽ سان هموار ڪرڻ جي ضرورت آهي.ان کي مشين تي رکڻ کان اڳ سينٽرفيوج ڪرڻ بهتر آهي، ته جيئن ٽيوب جي ڀت تي مائع هيٺ وهي سگهي ۽ هوائي بلبلز کي هٽائي.

⑤ عام وکر جو تجزيو

منطقي ترقيءَ جو ڪوبه عرصو ٽيمپليٽ جي ممڪن طور تي اعلي ڪنسنٽريشن
CT جو قدر ناهي فلورسنٽ سگنل ڳولڻ لاء غلط قدم؛
پرائمر يا پروبس جي خرابي - ان جي سالميت کي PAGE الیکٹروفورسس ذريعي ڳولي سگهجي ٿو.
ٽيمپليٽ جي ڪافي مقدار؛
ٽيمپليٽس جي خراب ٿيڻ - ناپاڪي جي تعارف کان بچڻ ۽ نموني جي تياري ۾ بار بار منجمد ۽ پگھلڻ؛
سي ٽي> 38 گھٽ وڌائڻ جي ڪارڪردگي؛PCR پيداوار تمام ڊگهو آهي؛مختلف ردعمل جزا خراب ٿي ويا آهن
لڪير وڌائڻ وارو وکر بار بار منجمد ٿيڻ واري چڪر يا روشني جي ڊگهي نمائش سان جاچ جزوي طور تي خراب ٿي سگھي ٿي
نقلي سوراخ ۾ فرق خاص طور تي وڏو آهي رد عمل جو حل مڪمل طور تي ڳريل نه آهي يا رد عمل جو حل نه ملايو ويو آهي؛پي سي آر اوزار جو حرارتي غسل فلورسنٽ مواد سان آلوده آهي

2.5 ڊيٽا جي تجزيو بابت

qPCR جي ڊيٽا تجزيي کي ورهائي سگهجي ٿو لاڳاپو مقدار ۽ مطلق مقدار ۾.مثال طور، علاج گروپ ۾ سيلز ڪنٽرول گروپ ۾ سيلز جي مقابلي ۾،

ايڪس جين جي ايم آر اين اي ڪيترا ڀيرا تبديل ٿي، اهو نسبتا مقدار آهي؛سيلز جي هڪ خاص تعداد ۾، ايڪس جين جو mRNA

ڪيتريون ئي ڪاپيون آهن، اهو مطلق مقدار آهي.عام طور تي جيڪو اسان ليبارٽري ۾ تمام گهڻو استعمال ڪندا آهيون اهو نسبتا مقدار وارو طريقو آهي.عام طور تي،2-ΔΔct طريقوتجربن ۾ سڀ کان وڌيڪ استعمال ڪيو ويندو آهي، تنهنڪري صرف اهو طريقو هتي تفصيل سان متعارف ڪرايو ويندو.

2-ΔΔct طريقو: حاصل ڪيل نتيجو تجرباتي گروپ ۾ ٽارگيٽ جين جي اظهار ۾ فرق آهي ڪنٽرول گروپ ۾ ٽارگيٽ جين جي نسبت.اهو ضروري آهي ته ٽارگيٽ جين ۽ اندروني ريفرنس جين ٻنهي جي افاديت جي افاديت 100٪ جي ويجهو هجي، ۽ لاڳاپا انحراف 5٪ کان وڌيڪ نه هجڻ گهرجي.

حساب ڪتاب جو طريقو هن ريت آهي:

Δct ڪنٽرول گروپ = ڪنٽرول گروپ ۾ ٽارگيٽ جين جو سي ٽي قدر - ڪنٽرول گروپ ۾ اندروني ريفرنس جين جو سي ٽي قدر

Δct تجرباتي گروپ = تجرباتي گروپ ۾ ٽارگيٽ جين جو ct قدر - تجرباتي گروپ ۾ اندروني ريفرنس جين جو ct قدر

ΔΔct = Δct تجرباتي گروپ-Δct ڪنٽرول گروپ

آخر ۾، اظهار جي سطح ۾ فرق جي گھڻن جو حساب ڪريو:

Fold = 2-ΔΔct تبديل ڪريو (ايڪسل فنڪشن سان لاڳاپيل پاور پاور آهي)

لاڳاپيل مصنوعات:

سيل سڌو RT-qPCR کٽ
siRNA in4 بابت ڪجھ تجربو


پوسٽ جو وقت: مئي-20-2023